Вслед за Египтом под руководством Клеопатры Firaxis представила для Civilization VI Японию, которая требует кардинально другого подхода.
Страной восходящего солнца руководит Ходзе Токимунэ, исторически восьмой правитель Японии, распространивший дзен-буддизм и отразивший вторжение Монгольской империи.
Японская цивилизация имеет особую предрасположенность к строительству маленьких, густонаселенных и высокоразвитых городов. Особая способность «Реставрация Мэйдзи» дает городам бонусы, если районы расположены вплотную друг к другу.
Кроме того, японцы создают лучшую электронику. Обычные фабрики они могут улучшать до фабрик электроники, которые повышают производительность промышленных зон и поднимают культуру в близлежащих городах.
Японские войска идеальны для обороны островов: наземные войска лучше сражаются на побережья, а корабли получают бонус вблизи берега. Элитными войсками Японии выступают самураи, которые не теряют боевого духа даже если несут потери, что позволяет им давать достойных отпор нескольким противникам сразу.