Издатель, как сообщается, подал жалобу на оригинал и созданные на его основе форки.
Метроидвания изначально была разработана Daisuke ‘Pixel’ Amaya и впервые выпущена в 2004 году и распространялась бесплатно, до того, как Nicalis начал работу с ним над разработкой портов для Wii и DS.
Nicalis также разработала обновлённые версии, включая Cave Story + и Cave Story 3D для Nintendo и Steam.
Бесплатная версия была декомпилирована и использовалась для создания ряда фанатских проектов, включая Cave Story Engine 2, который позволяет пользователям создавать свои собственные версии игры.
Однако GitHub репозиторий Cave Story Engine 2 был закрыт после того, как Nicalis отправил DMCA, утверждая, что проект использует исходный код их версии Cave Story.
Различные разработчики и некоторые известные профессионалы отрасли, такие как Рами Исмаил, осудили этот шаг, полагая, что на всё, что основано на бесплатной версии, Nicalis не имеет прав.