системная биология

Генные сети, управляющие строением тела животных

Как при помощи генных сетей превратить яйцо сначала в личинку, а затем во взрослую муху? Муха, как и другие насекомые, состоит из сегментов. Сегменты объединяются в три группы — голова, грудь и брюшко. На сегменте может быть пара конечностей. В…
Читать дальше

Сборка схем из биологических переключателей

(предыдущая статья цикла: geektimes.ru/post/283686) Логика включения оперонов разных путей обмена веществ у кишечной палочки близка к элементам AND и OR. Поэтому на их основе можно сделать генную конструкцию, реализующую произвольную логическую схему (не слишком сложную). Существуют программы, например Cello, которые…
Читать дальше

Математика биологических переключателей

(продолжение. Предыдущая часть: «Автоматика из ДНК и белков: что у нее общего с электроникой?») Мы остановились на том, что лактозный оперон похож на логический элемент AND. Но откуда у него берутся цифровые свойства? Ведь оба входных сигнала (концентрации цАМФ и…
Читать дальше

Автоматика из ДНК и белков: что у нее общего с электроникой?

(ответ биолога на статью «Вы неправильно пишете животных») В каждой клетке есть тысячи генов. Никогда не бывает так, чтобы они все работали одновременно. Клетки мышц, печени и мозга несут одинаковый набор генов. Они такие разные, потому что в них работают…
Читать дальше