Генетические методы создания новых сортов и адаптационный потенциал растений

Искусственная селекция сегодня присутствует в каждой булочке, печенье, тарелке карбонары или пицце «пепперони». Мы редко задумываемся, что всего век назад урожайность зерновых падала с 1000 кг/га до 300 кг/га, и из-за этого миллионы людей умирали от голода.

В условиях постоянно усиливающейся жары и дефицита осадков в Казахстане встал вопрос о повышении продуктивности пшеницы при минимумe воды. К 2019 году национальные селекционеры вывели 45 сортов озимой пшеницы с разными генетическими задатками и потенциалом урожайности. Озимая пшеница хоть и уступает яровой по максимальным показателям, но в засушливых регионах показывает более стабильные результаты. Оставалось опробовать новинки в полевых условиях.

Screening of Winter Wheat Accessions from International Variety Trials for Drought Resistance in Southeastern Kazakhstan

С 2019 по 2022 год сорта проходили трёхлетние испытания — без этого невозможно оценить стабильность показателей. Генетика — не волшебство, а системная работа: каждый сорт анализируют по сотням маркеров, строят генетические карты и прослеживают все преобразования. По итогам полевых опытов лидерами стали:

  • BONITO-37/MV10-2000 — до 5300 кг/га;
  • LYMARIVNA — до 5600 кг/га, а при достаточных осадках 9000–11000 кг/га;
  • OK12D22004-016 — до 5200 кг/га.

Важно: сорт LYMARIVNA помимо засухоустойчивости должен быть устойчив к грибным и бактериальным болезням, не вылеживаться при ветре и не осыпаться после дождей.

Генетические методы создания новых сортов и адаптационный потенциал растений

Для сравнения: в СССР в 1932 году, при жестокой засухе, урожай озимой пшеницы на Украине составлял около 500 кг/га, а в Казахстане из-за ещё более сухого климата — на 30% меньше.

Урожайность озимой пшеницы в 1932 году

Сорт СТЕКЛОВИДНАЯ 24 (1995 год) в засушливые годы давал порядка 2000 кг/га, тогда как без дополнительного полива в обычные сезоны — около 2600 кг/га. Новые же гибриды начинают давать вдвое больше даже при серьёзной засухе.

Опытную станцию разместили в Заилийском Алатау (48° с. ш., 77° в. д.). Каждый сорт высевали в трёх блоках по 10 м² на светло-каштановых среднесуглинистых почвах с 3,0% гумуса (0–30 см), общий азот — 0,15%, фосфор — 0,21%, калий — 1,67%.

Dynamics and Malleability of Plant DNA Methylation During Abiotic Stresses

Ключевая сложность селекции — эпигенетическая реакция растений на стресс. При засухе или жаре одни гены замедляются, другие активируются; при повторных высеваниях урожайность может падать, и прежние «успешные» варианты вдруг начинают болеть. Простая селекция с 1920-х уже не справляется: нужно проверять эпигеном, фиксировать метилирование, модификации гистонов и РНК-маршруты, чтобы найти действительно устойчивые линии.

Эпигенетика включает:

  1. Реакцию на стресс (засуха, жара, тяжёлые металлы) через изменение уровня метилирования генов.
  2. Активацию генов, связанных с транспортом ионов, антиоксидантной защитой, гормональным и вторичным обменом.
  3. Наследование эпигенетических меток внутри растения (митоз) и иногда между поколениями (мейоз).
Схема метилирования ДНК и деметилирования у Arabidopsis thaliana
Механизмы метилирования и деметилирования ДНК у Arabidopsis thaliana. Метильные группы (5mC) добавляются и удаляются специальными ферментами, отвечая на сигналы среды и развития.

Однако эпигенетическая регуляция весьма вариабельна: каждая клетка, каждое растение реагирует по-своему, и на уровне потомства результаты могут сильно отличаться. Поэтому селекция на основе только эпигенетики сталкивается с нерегулярностью и неопределённостью.

Тренировки растений «приучить» к засухе в прошлом были обречены: эпигенетические метки исчезают или меняют направление, как только условия возвращаются к норме. Но одновременный анализ генотипа и эпигенотипа позволяет отобрать стабильные наследуемые изменения и усилить традиционную селекцию.

Примеры эпигенетической реакции на жару:

  • У Arabidopsis при +10–15 °C выше нормы нарушается структура гетерохроматина, активируются гены ELF7, DEL2, BRF3, и растение вместо паузы пытается расти, что приводит к гибели.
  • У кукурузы меняется метилирование 325 генов, участвующих в репарации ДНК, синтезе крахмала, сборке сплайсосомы, транспорте РНК и углеродном обмене; девять генов усиливают сплайсинг.
  • У Populus simonii микронуклеиновые РНК перестраивают экспрессию генов липидного и окислительного обмена.
  • У хлопка тепловой стресс затрагивает метилирование 5130 генов, связанных с гормональным обменом, синтезом тиамина, глутатиона и тирозина.
  • Рис при жаре формирует более мелкие семена из-за подавления OsCMT3 и активации OsFIE1 — так растение жертвует размером семени ради выживания потомства.
Эпигенетическая реакция Arabidopsis на жару
Изменения метилирования генов у Populus simonii и хлопка

При любом ухудшении условий тысячи генов мгновенно меняют свою активность. Эти изменения быстро накапливаются, могут сохраняться несколько поколений, но при смене условий либо откатываются, либо трансформируются в новые настройки. В природе нет стабильности в нашем понимании — есть лишь выживание и продолжение рода.

Это же ограничивает вмешательство в геном: нанести или удалить один ген недостаточно — сотни и тысячи других адаптируются вслед за ним. Гены работают сетями, и любое изменение одного участка неизбежно влечёт эпигенетические перестройки по всему геному. Эффективнее всего сочетать традиционную селекцию, генетический анализ и мониторинг эпигенетических меток.

По той же причине сложна терапия генетических заболеваний у человека: раковые мутации затрагивают сотни генов, и исправление лишь части из них вызовет каскад новых изменений. Зато можно влиять на иммунитет и метаболизм при помощи биохимических модификаторов, опираясь на точный генотипный и эпигенетический анализ.

 

Источник

Читайте также