«Эффект Плутона»: ученые TransCODE классифицировали 1700 скрытых малых белков

Международная коллаборация, объединившая 60 ученых из более чем 30 ведущих институтов, опубликовала в журнале Nature результаты масштабного исследования, официально закрепившего открытие нового типа молекулярных соединений в организме человека. Исследователи каталогизировали 1700 микробелков, которые на протяжении десятилетий оставались вне поля зрения генетиков и отсутствовали в базах данных. Для этих образований, ранее фигурировавших как «тёмные» или «неканонические» белки, был утвержден термин «пептидеины» (peptideins), синтезированный из понятий «пептид» и «протеин».

Руководителями научной работы выступили доктор Себастиан ван Хесх из Центра детской онкологии принцессы Максимы в Нидерландах и группа экспертов из Мичиганского университета. Основная причина, по которой эти молекулы так долго ускользали от внимания, кроется в их миниатюрных размерах и уникальности — они лишены гомологичных аналогов у других биологических видов. Нередко эти соединения кодируются фрагментами ДНК, граничащими с уже изученными генами или даже накладывающимися на них. Из-за этого аналитические алгоритмы предыдущих лет ошибочно классифицировали их как генетический «мусор» или случайные продукты клеточного метаболизма.

Исследователи проводят параллель с «астрономическим моментом Плутона», когда обнаружение множества объектов в поясе Койпера потребовало пересмотра классификации планет. Аналогичным образом, открытие пептидеинов фундаментально меняет понимание структуры человеческого генома. Классификация белков становится более гибкой: некоторые из тех, что считались каноническими, могут быть переквалифицированы в пептидеины, тогда как другие, наоборот, перейдут в разряд жизненно необходимых белков. На данный момент уже подтверждено, что более 50 из них играют ключевую роль в обеспечении жизнедеятельности клеток, а их дефицит вызывает мгновенную гибель последних.

Официальное признание пептидеинов знаменует качественный скачок в медицинской науке. Установлено, что данные молекулы напрямую связаны с патогенезом агрессивных форм детских опухолей мозга и нарушениями в функционировании миокарда.

Сведения о 1700 выявленных пептидеинах уже внесены в авторитетные глобальные базы данных, такие как GENCODE и UniProt. Это позволит специалистам в области генетики и онкологии по всему миру учитывать их в своей работе, открывая доступ к ранее «невидимым» мишеням для высокоточной таргетной терапии.

Источник: iXBT