Сиэттлский Институт Аллена представил Brain Knowledge Platform — цифровую систему, которую разработчики называют на сегодняшний день наиболее всесторонним инструментом на базе ИИ для работы с нейронаучными данными. Задача проекта — централизовать информацию о мозге, поступающую от множества исследовательских групп по всему миру, и превратить её в согласованный, единообразный корпус знаний.
В платформу интегрированы данные по различным видам — человеку, другим приматам и мышам — а также образцы с этапов эмбрионального развития до старческой возрастной группы. В едином массиве собраны сведения о типах клеток, возрастных трансформациях, признаках патологий и иных биологических показателях. Благодаря алгоритмам искусственного интеллекта все эти данные унифицированы в формате, который позволяет напрямую соотносить результаты разных лабораторий и видов организмов и работать с ними как с одной крупномасштабной базой.
«Понимание мозговых механизмов — это не задача одного учреждения. Необходимо объединять усилия всего сообщества», — подчеркнул руководитель направления данных и технологий Института Аллена Шоаиб Муфти. Одним из ключевых факторов запуска платформы стала возрастающая нагрузка неврологических заболеваний. По оценкам Института показателей здоровья и оценки (IHME), за последние десятилетия существенно увеличилось число людей с последствиями инсультов, болезнью Альцгеймера, деменциями, менингитом и прочими расстройствами нервной системы. В 2021 году различные неврологические нарушения затронули порядка 3,4 млрд человек — от черепно-мозговых травм до мигреней.
Для создания Brain Knowledge Platform Институт Аллена привлек к сотрудничеству организации и проекты, готовые делиться данными на добровольной основе. Среди них – подразделение Allen Institute for Brain Science, Фонд Майкла Дж. Фокса по исследованию болезни Паркинсона, коллективы Вашингтонского и Гарвардского университетов, проект Seattle Alzheimer’s Disease Brain Cell Atlas (SEA-AD) и другие партнёры. Существенную часть базы составляют сведения о лабораторных животных, а также обезличенные данные от 84 посмертных доноров человеческого мозга.
Техническую инфраструктуру платформы разработал Amazon Web Services, а модели искусственного интеллекта для анализа нейробиологических данных создала компания Google. По словам Муфти, Brain Knowledge Platform задумана как «площадка для открытий»: она служит не только инструментом для проверки заранее сформулированных гипотез, но и средой для выявления закономерностей в крупных наборах данных.
Одним из ключевых преимуществ ресурса является возможность мгновенно сопоставлять данные по различным патологиям. То, что раньше требовало кропотливой ручной обработки, теперь доступно в едином пользовательском интерфейсе.
Исследователи могут, например, в стандартизированном формате сравнивать профили мозга при болезни Альцгеймера и болезни Паркинсона.
Платформа предоставляется научному сообществу на бесплатной основе. Команда проекта рассчитывает, что к ней присоединятся новые участники и загрузят свои собственные наборы данных. Для этого разрабатывается механизм точного указания вклада авторов, который обеспечит признание их работы и поспособствует открытому обмену информацией.
Источник: iXBT
